基因組數據與機器學習算法相結合 預測某人未來罹患白血病的風險

2022-07-13 10:20:59   來源:科技日報

英國科學家在最新一期《自然·醫學》雜志上發表論文稱,他們可根據血細胞內發生的突變,結合基因組數據與機器學技術,預測某人未來罹患白血病的風險。

白血病通常是血細胞生產的精細衡(新血細胞被制造出來,舊血細胞死亡)被破壞的結果。隨著年齡增長,血液干細胞會發生突變,這可能意味著改變后的細胞比其他血細胞更具生長優勢,且在數量上超過其他血細胞,這就是所謂的適應優勢。

英國愛丁堡大學和格拉斯哥大學研究人員調查了血液生產中發生的適應優勢變化,以及如何根據這些突變預測某人未來罹患白血病的風險。

該研究負責人之一、愛丁堡大學塔米爾·錢德拉博士解釋道,他們測量了洛錫安區隊列(LBCs)中83名老年人血液樣本的變化。LBCs隊列是有關大腦、認知和衰老的縱向研究項目,包括1921隊列和1936隊列,參與者如今已經八九十歲,這些人在11歲時就參加了智力測試。

錢德拉等人每3年對1921隊列中70—82歲的個體、1936隊列中79—92歲的個體進行一次隨訪,然后研究團隊將這些復雜的基因組數據與機器學算法相結合,將不同的突變與攜帶這些突變的造血干細胞的不同生長速度關聯起來。

研究發現,在無白血病人群中,特定突變給血液干細胞帶來了明顯的適應優勢。這可用來預測突變細胞的生長速度,從而決定實驗對象罹患白血病的風險。不過,研究團隊也表示,由于當前研究樣本數量有限,還需要進一步在更大群體中驗證這些結果。

該研究聯合負責人、格拉斯哥大學癌癥科學研究所的克里斯蒂娜·克什納博士說:“在了解某個患者有罹患白血病的風險后,臨床醫生可縮短最有可能罹患白血病的患者的預約間隔,盡早開展治療。”(科技日報記者 劉霞)

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